Svet zavoda je organ upravljanja. Sprejema najpomembnejše splošne akte, program dela in razvoja zavoda, finančni načrt in letno poročilo, skladno z zakonom imenuje in razrešuje direktorja, izvaja pravice in obveznosti delodajalca v razmerju do direktorja zavoda ter opravlja druge z zakonom, sklepom o ustanovitvi, drugimi predpisi ter statutom VDC Kranj določene zadeve.
Sestavlja ga sedem članov – štirje predstavniki ustanovitelja (RS) ter po en predstavnik delavcev VDC Kranj, invalidskih organizacij in zakonitih zastopnikov oz. skrbnikov.
Mandat članov traja štiri leta in so lahko ponovno imenovani oziroma izvoljeni.
Po izteku mandatnega obdobja 2021-2025 so bili na 1. konstitutivni seji Sveta zavoda VDC Kranj dne 31.3.2025 za mandatno obdobje 2025-2029 skladno z ZSV imenovani:
Člani sveta zavoda v mandatnem obdobju 2025-2029:
- Alen Gril, predstavnik ustanovitelja
- Branka Jakšić, predstavnica ustanovitelja
- Ines Šmon, predstavnica ustanovitelja
- Marko Močnik, predstavnik ustanovitelja
- Uroš Tičar, predstavnik zakonitih zastopnikov/skrbnikov
- Emil Hafnar, predstavnik invalidskih organizacij
- Marjetka Nikolić, predstavnica zaposlenih
